自古以来，在佛教、日本本土神话以及很多其他地方的神话传说中，对“水”的崇拜和信仰一直贯穿始终。相传，古印度神界的最高统治者叫伐楼拿，是天空，雨水及天海之神，以海兽为坐骑。
后来伐楼拿演变为佛教的护法神，被称为“水天”。
明治政府曾经颁布“神佛分离令”，使佛教和日本本土宗教分开，“水天”又演变为日本本土宗教中的“天之御中主神”。水天宫祭祀的就是“天之御中主神”。

水天宫的神灵庇佑和“水”有关的事情，比如行船、河运海运、农业灌溉、打渔、免除洪涝灾害等等，更为重要的时，水天宫保佑孩子平安出生和茁壮成长。
在日本人看来，和其他动物相比，狗妈妈生狗宝宝比较容易，所以每逢日本老黄历中的“戌之日”，水天宫往往人头攒动，人们相拥而至，虔诚祈祷孩子的健康。
“戌之日”按照十二地支的顺序，每12天一次，2016年1月的“戌之日”为5日、17日和29日，2月的“戌之日”为10日和22日。

水天宫的总社位于福冈县久留米市，北海道的札幌市小樽市、埼玉县的所沢市、东京的中央区丰岛区立川市、静冈县的烧津市、熊本县的山鹿市等等均有分布。