法隆寺佛教古跡是日本1993年最早稱為世界遺產的四座古跡之一。世界遺產包括在法隆寺和法起寺的一部分建築。這些建築建於公元7世紀末至8世紀初，是世界上現存最古老的木結構建築。法隆寺建於公元607年，著名的金堂和五層寶塔等建築，充分體現了日本的藝術和文化。這些建築還體現了佛教對日本的重要影響。

京都是日本的古代首都，是一千多年來日本的文化中心。教科文組織的世界文化遺產包括了京都在內的17個地區，13所寺廟和3個神社。這些都在1994年獲得認證。好多遺產地區都是最有人氣的景點。如清水寺，金閣寺，龍安寺，平等院等。這些地方展現了日本的傳統文化，遊客們可以體會到日本古老的魅力和迷人之處。

嚴島神社在廣島縣的宮島地區，1996年成為教科文組織的世界遺產。嚴島神社是日本最獨特和美麗的神社。 最聞名的鳥居 漲潮時“漂浮”在海上，落潮時才露出海面。神社起建於6世紀，神社的一部分建築已經列為國寶。這個區域也有很多鹿群。鹿群經過馴養，自在的在遊人身側玩耍。

奈良是日本第一個首都，也是日本很多重要的歷史文化發源地。也是日本國家的發源地。1998年成為教科文組織認可的世界遺產。包括奈良在內的8個地區， 六個佛教寺廟和一個神社。東大寺、春日大社、興福寺、藥師寺都包括其中。

日光作為日本神道和佛教的中心，流傳幾個世紀。也是德川幕府時代的重要宗教地區。除了精美的建築之外，風景也格外優美。1999年，成為教科文組織的世界遺產。包括103座建築，兩個神社和一個佛教寺廟。二荒山神社和東照宮，輪王寺都包括在內。日光也因為自然風景格外美麗而成為著名的旅遊景點。

大峰、熊野三山以及高野山三座聖地坐落在紀伊山地茂密的森林中，俯瞰太平洋。2004年成為世界教科文組織認可的世界遺產。該遺址及其周圍的森林景觀是1200多年來持續保留完好的聖山傳統的寫照。它們通過多條參拜古道連接奈良和京都兩個古都，這個地區連同其豐富的小溪、河流和瀑布仍然是日本現存文化的一部分，每年吸引多達1500萬遊客來參拜和遊覽。

岩手縣平泉地區有5處世界遺址，2011年獲得認證。其中的中尊寺，公元850年修建，金色堂全部鑲金，世界聞名。毛越寺毗鄰中尊寺，建於9世紀，展出了日本獨特的規劃與園林設計理念。平泉地區保存了11世紀至今的3000多件國寶，記錄了日本的歷史。

富士山是日本的地標。坐落在本州島嶼上，東京的西南方向100多公裏處。海拔3776米，是日本的最高山峰。富士山2013年成為教科文組織世界文化遺產（並不是自然遺產），是因為富士山給很多文學作品帶來靈感。例如葛飾北齋的富獄三十六景，也是日本著名的朝聖之所 。教科文組織認證了包括富士山在內的25個地區。還包括了富士山本宮淺間大社和六個其他的神社。